芘核碱基共轭物的合成

最近我们在实验室开发了一种直接的，一锅两步的芳基核碱基方法，并对各种芳基原料进行了检测[24-26]。在这项工作中，原料1-（3-氯丙酰基）芘（1）是通过芘与3-氯丙酰氯的Friedel-Crafts反应得到的[27]。随后，通过1-（3-氯丙酰基）芘（1）分别与胸腺嘧啶和腺嘌呤反应获得芘基 - 核碱基缀合物2和3（方案1）。

后处理后，分离出化合物2和3，为黄色固体，分别产率为54％和56％。在下一步骤中，用硼氢化钠还原2中的羰基官能团，得到醇4，为无色固体，91％收率。令人惊讶的是，试图降低腺嘌呤衍生物3中的羰基功能失败了。在与2相同的条件下进行反应，得到产物的复杂混合物。为了解决这个问题，使用氢化铝锂作为还原剂。在这种情况下，反应顺利进行，得到5，为无色固体，产率85％（方案1）。所有芘基衍生物1 - 5通过其特征在于1 H NMR，13 C NMR和IR光谱，质谱和元素分析，并且分析数据证实了提出的结构。此外，通过单晶X射线分析证实了芘基 - 胸腺嘧啶2的分子结构。

水晶结构

通过将戊烷缓慢扩散到2的氯仿溶液中获得适于X射线衍射分析的2的晶体。具有原子标记方案的橡树脊热椭圆体图（ORTEP）如图2所示，以及选定的键长和角度。晶体和结构细化数据在支持信息文件1中给出（表S1）。

化合物2在单斜晶I 2 / a空间群中作为氯仿溶剂化物结晶，在晶胞的不对称部分中具有一对给定分子。结晶结构证实C1-取代的芘通过1-氧代丙酰基连接基与胸腺嘧啶部分的N20原子连接。芘基部分的几何形状偏离0.039的平面度[28]而胸腺嘧啶基团的平均偏差为0.011Å。由取代的芘和胸腺嘧啶环系统的非氢原子描绘的平面彼此以84.01（2）°取向。在晶体中，羰基官能键C17 = O26从芘基部分的平面倾斜。因此，由C1 / C17 / C18 / O26原子和芘基的非氢原子描绘的平均平面倾斜17.26（5）°的角度。羰基氧原子O26与芘基的氢原子H3参与分子内氢键。C3-H3 ... O26氢键长度为2.879（2）Å。在固态下，化合物2的每个独立分子形成通过N22-H22酰氨基与胸腺嘧啶部分的C21 = O27羰基功能之间的氢键稳定的二聚体结构（图3）。N22···O27距离为2.882（2）Å，而N22-H22···O27角为174（3）°。在茂金属 - 核碱基衍生物的分子结构中观察到类似的二聚体系[24,29]。此外，二聚体中每个2的分子进一步与相邻的氯仿分子参与Cl···O卤键