- A+
推荐一篇发表在 ACS Chem. Biol. 上的文章,文章标题是"ATP Regeneration by Polyphosphate Kinase Powers Efficient Oligosaccharide Synthesis Catalyzed by Glycoside Phosphorylases"。其通讯作者是山东大学的顾国锋教授和刘现伟副教授。顾国锋课题组主要研究方向是基于活性糖分子化合物的设计、合成以及生物活性研究,进而筛选糖类药物分子;刘现伟课题组主要研究方向是糖及糖缀合物的化学酶法合成,糖及蛋白的化学标记和修饰,糖及蛋白的生物学功能及应用研究等。

聚糖是生物必需的化合物,具有多种结构和功能作用。酶促合成是生产特定聚糖的重要方法,无需化学方法所需的费力的保护基。 糖苷磷酸化酶(GPases)是一类特殊的碳水化合物活性酶,使用糖-1-磷酸盐作为能量供体,可以绕过核苷酸糖的需求,降低了成本,并且可以从实验室体系扩展到工业生产上。 虽然 GPases 可以绕过核苷酸糖的需求,但是对于 ATP 驱动激酶的依赖仍然是一个成本问题。在这项研究中,作者利用糖-1-激酶(S1K)和 7 个 GPase,与 PolyP/PPK 介导的 ATP 再生偶联,建立了一系列一锅三酶系统(图 1)。该系统无需外加 ATP,利用 GPase 的立体选择性,能够高效地合成多种结构的寡糖,并且消除了对外源三磷酸核苷酸的依赖。 图 1. GPase、S1K 和 PPK 偶联催化低聚糖的一锅三酶合成。
首先,为了探索 GPase 催化的 ATP 再生合成反应的可行性,作者以 LNB 为对象,优化反应条件,利用 GalK、BiGLNBPase 和 EbPPK 建立合成 LNB 的一锅三酶级联反应体系(图 2)。
图 2. LNB(Galβ1-3GlcNAc,1)和 GNB(Galβ1-3GalNAc,2)的一锅三酶合成。 结果表明,随着 PolyP 浓度的增加,LNB 的产率逐渐增加(图 3A),在 20 mM 后基本保持不变,因此 PolyP 的浓度选择 20 mM,同样地将 MgCl2 的浓度确定为 20 mM(图 3B)。随后,作者测试了 ATP 浓度对反应产率的影响(图 3C)。结果表明,即使在 ATP 浓度仅为 0.1 mM(0.0022 当量)时,产率仍可达到最大产率的 79%,表明在辅因子再生系统的存在下,极低的 ATP 浓度也可以支持反应的进行。ATP 浓度为 2 mM 时产率最高,进一步增加浓度也不利于转化,因此 ATP 的浓度选择 2 mM。最后,由于 EbPPK 可以将 AMP 和 ADP 转化为 ATP,作者测试了这三种辅因子对反应的产率的影响,结果发现并无显著差异(图 3D)。出于成本考虑,作者在后续实验中使用 AMP 作为起始辅因子。 相比此前的方法,该方法可以利用更高的底物浓度,仅使用 2 mM 的 AMP(0.044 当量),显着降低了底物的成本,并且保持了原有的产率。 图 3. LNB 合成条件的优化。 接下来,作者将 EbPPK 介导的 ATP 再生与多种甘露糖苷磷酸化酶(MPases)偶联,开发了一种简化的一锅系统,可以直接通过单糖和多磷酸盐合成多种 β-甘露糖苷。 以 β-1,2-甘露三糖为例,通过TXMPase、NahK 和 EbPPK 合成,经过分离纯化后,产率为 40%。相比于之前报道的 NahK/TXMPase 系统(产率为 57%),产率有所下降,但是以 0.013 当量的 AMP 替代了 1.0 当量的 ATP,大大降低了成本,同时底物浓度增加了 5 倍以上,显着增强了实用性,提高了扩展到生产上的适用性。 图 4. β-甘露糖苷的一锅三酶合成。 最后,作者利用 VpCPase、NahK 与 EbPPK,合成 N,N'-二乙酰壳二糖,产率为 52%(图 5)。以 GlcNAc 和 PolyP 为主要底物,以 AMP 作为起始辅因子,实现了 N,N'-二乙酰壳二糖的克级生产。 对于叠氮化物,以化学合成的 GlcNAcβEthN3 为受体底物反应,产率可达 51%。继续以该叠氮化物为受体,通过一锅三酶甘露糖基化系统进一步合成了 N-聚糖核心三糖—— Manβ1–4GlcNAcβ1–4GlcNAcβEthN3),产率可达 40%,与先前需要外源 ATP 和糖-1-磷酸的方法的产率相当。 图 5. N,N'-二乙酰壳二糖(GlcNAcβ1–4GlcNAc,9;GlcNAcβ1–4GlcNAcβEthN3,10)和 N-聚糖核心三糖(Manβ1–4GlcNAcβ1–4GlcNAcβEthN3,11)的一锅三酶合成。



在本研究中,作者通过将 PPK 介导的 ATP 再生与 GPase 相结合,用于合成结构多样化的低聚糖,解决了 GPase 催化聚糖合成中的两个关键瓶颈:通过 PolyP 驱动的再生,无需添加外源的 ATP;通过最大限度地减少 ADP/ATP 积累,规避了核苷酸的抑制。该方法在多种类型的低聚糖合成中实现了中高产率,具有立体选择性和操作简单性,提高了合成效率,降低了成本。
———————— 文章作者:CXY 原文链接: https://doi.org/10.1021/acschembio.5c00567

目前评论:0