Nat. Methods | CaBLAM:一种高对比度生物发光Ca2+指示剂

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分享一篇发表在Nature Methods上的文章:CaBLAM: a high-contrast bioluminescent Ca2+ indicator derived from an engineered Oplophorus gracilirostris luciferase,通讯作者是来自加州大学圣地亚哥分校的Nathan C. Shaner教授,该课题组的研究方向是荧光探针、传感器、成像等。


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基因编码钙指示剂(GECI)是现代神经科学的核心工具,但荧光型(GCaMP、GECO 系列)依赖高强度激发光,带来光漂白、光毒性、背景自发荧光及硬件束缚,限制成像与自由活动实验。生物发光(BL)GECI 无需激发光,理论上可消除上述缺陷,但现有的BL-GECI存在两个缺陷:1)基线发光高,动态范围仅2–4 倍;2)Ca²⁺亲和力过高或过低,对生理浓度(50–1000 nM)不敏感。因此,该领域内尚无性能可与“金标准”GCaMP8比肩的BL探针。

为了克服以上困难,作者重新开发了一个高对比度生物发光Ca2+指示剂CaBLAM(Calcium Bioluminescence Activity Monitor)。简而言之,作者首先以深海虾Oplophorus gracilirostris荧光素酶(OLuc)变体eKAZ为模板,以提高发光强度与可溶性。通过交替使用易错PCR与定点饱和突变,通过定向进化获得高活性、高可溶性、易融合的新骨架SSLuc。


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随后,作者需要进行传感器拓扑构建,他们在SSLuc末段β-折叠环处拆分,插入Ca²⁺感知模块RS20–CaM(钙调蛋白结合肽-钙调蛋白)。该“分裂-互补”策略使钙结合引起的构象变化直接调控荧光素酶活性。此外,作者还进行了亲和力与对比度并行优化。替换CaM序列为 GCaMP6s 来源,引入天然突变N98I降低亲和力;通过EF-hand额外突变得到Kd≈440 nM 的主版本(CaBLAM),并衍生出280 nM(332W)与3 µM(294W)版本,覆盖不同钙动态范围。作者还系统性筛选了120条C-端短肽(自抑制肽),发现低亲和肽VTGYRLLEEISN可最大限度放大“关-开”差异,使体外绝对对比度达83倍(饱和钙 vs 零钙),为现有BL-GECI 最高值。

作者在细胞水平上对传感器的性能进行了验证,并把它用在大鼠海马体神经元中,比较CaBLAM与最先进的荧光传感器GCaMP8s的性能差异。作者计算了CaBLAM诱发的生物发光变化,显示其可靠地报告了细胞内Ca2+的变化,且ΔL/L信号发生了显著变化。对于 GCaMP8s,尽管GCaMP8s整体更明亮,但是它荧光的基线很高,变化量(ΔF/F)较少。这说明了CaBLAM具有更高的信噪比。


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最后,作者还在小鼠和斑马鱼中进行了尝试,在清醒、行为正常的动物中持续数小时成像。


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总而言之,本文作者开发了新型钙离子指示器CaBLAM,补充了钙成像的工具箱。


本文作者:MB

责任编辑:LZ

DOI:10.1038/s41592-025-02972-0

原文链接:https://doi.org/10.1038/s41592-025-02972-0



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