通常，在酶的催化中心中发现碱性氨基酸，如赖氨酸或精氨酸。因此，模拟这些碱性氨基酸的炔丙基胺特别适合掺入肽模拟物中。已经进行了碱性氨基酸的交换以开发有效的酶抑制剂[102-104]。为了将具有碱性氨基部分的侧链引入炔丙胺，必须保护它们免于亲核试剂，碱基和去质子化。
根据Ye等人的方法，使用3-溴丙基侧链，其被转化为叠氮化物并通过Staudinger还原进一步转化为氨基烷基[16]。为了遵循更加趋同的方法并避免后期卤化物的亲核取代，我们决定用4- 叠氮基丁醛开始合成，其通过用碘和NaBH 4开放THF，用叠氮化钠和亲核取代来制备。 Swern氧化酒精。
用手性亚磺酰胺（S）-1将4-叠氮基丁醛转化为N-亚磺酰亚胺5w，其与（三甲基甲硅烷基）乙炔基锂反应。然而，遵循通常的程序GP-4，在用水淬灭之前将反应混合物升温至室温，导致形成三唑13w，其以56％的收率分离（表4）。目标炔丙胺6wx仅以19％的收率获得。在0℃下用KF和18-冠-6裂解TMS基团，得到叠氮化物7wx，产率仅为22％，因为在副反应中形成三唑14w。化合物7wx即使在室温下在CDCl 3中静置，也将其转化为三唑14w（通过1 H NMR光谱监测，参见支持信息文件1）。三唑13w和14w的形成是出乎意料的，因为未催化的Huisgen反应通常需要更高的温度或通过在叠氮化物上的炔烃或给电子取代基上的吸电子取代基活化[105,106]。由于在6wx和7wx的情况下都不满足这些要求，假设叠氮化物和炔烃的预定向以及能量上有利的六元环的形成是驱动力。类似于己糖支架13瓦特和14瓦特都为β葡糖苷酶的抑制剂已成功地应用于[107]和hexosamidases [108] ，该分子内的Huisgen反应可能被利用来开发新颖酶抑制剂。
为了获得含有赖氨酸，鸟氨酸和精氨酸侧链的炔丙胺，应减少叠氮化物7wx。然而，由于竞争性三唑形成，所有用NaBH 4或PPh 3还原分离的叠氮化物7wx的尝试都失败了。因此，设想了原位制备的6wy的即时减少。通过分析型HPLC监测（三甲基甲硅烷基）乙炔基锂向N-亚磺酰亚胺5w的亲核加成。完全转化后，在-78℃下将PPh 3直接加入反应混合物中。加入水并搅拌2小时后，伯胺7wy分离出86％的产率。该方法得到鸟氨酸类似的炔丙胺7wy，其与Boc-保护的S-甲基异硫脲反应，得到精氨酸类似的炔丙基胺7x，收率79％。在施陶丁格反应中叠氮化物分解期间，同时裂解炔烃上的TMS基团。到目前为止，尚未报道在相似条件下用PPh 3切割TMS组。因此，假设分子内机制，其中由PPh 3与叠氮化物6wy反应形成的亚氨基正膦，坐标到甲硅烷基团。这种分子内配位有助于在水性后处理中甲硅烷基的快速水解裂解。该PPh 3诱导的TMS裂解也可以成功地应用于从5v合成赖氨酸类似的炔丙基胺7vy，但在相同的反应条件下不能再生成其它的炔丙胺，如叔丁基取代的化合物7e。用Boc基团保护7wy和7vy的胺基，得到炔丙胺7wz和7vz。
Ellman的手性亚磺酰胺已成功用于对映体纯的炔丙胺的不对称合成。已经制备了一系列24种非对映异构纯的N-亚磺酰基炔丙胺，其在α-位具有侧链，其与氨基酸侧链类似或相似。通常，各种醛与Ellman的手性亚磺酰胺缩合。非对映选择性重 -面添加（三甲基硅基）ethynyllithium到（的小号）构型sulfinimines 5给出了相应的N-亚磺酰基炔丙胺6。用TBAF或KF×18-冠-6裂解TMS基团提供N-亚磺酰基炔丙基胺7 用末端炔烃。
取决于Cα取代基的大小，以良好的产率获得具有脂族侧链的丙炔胺。可以使用掩蔽或保护的官能团引入侧链中的各种极性和碱性取代基。引入具有氨基的侧链作为叠氮化物掩蔽。为此，必须抑制前所未有的分子内Huisgen反应。吸电子在C取代β位上不能用这种方法来使用。吸电子取代基在C α - 位置在温和的碱性条件下诱导不可逆的炔 - 丙二烯-α，β-不饱和亚胺重排，这使得炔丙胺的碱性外消旋化不可能。总之，具有各种氨基酸相似取代基的大量炔丙基胺可用于肽模拟物，并且已经贡献了一些关于炔丙胺的反应性的知识。