【Chem. Sci.】酰胺核糖体合成肽的发现和表征

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核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)是一类结构多样的天然产物,具有广泛的生物活性。RiPP生物合成基因簇的基因组挖掘通常因短前体肽注释不当而受阻,短前体肽最终修饰成最终分子。近期,英国John Innes Centre的Andrew W. Truman组利用基因组挖掘工具RiPPER来识别YcaO结构域蛋白质附近的新型RiPP前体肽,YcaO能够催化各种RiPP翻译后修饰,包括杂环化和硫代酰胺化。

图片来源:Chem. Sci.


利用这一数据集,该研究鉴定了一个新的、多样的RiPP 生物合成基因簇家族,其中包括230多种放线菌和厚壁菌。

 


图片来源:Chem. Sci.



紧接着,对来自白色链霉菌J1074的代表性生物合成基因簇进行了表征,从而发现了streptamidine,一种含酰胺的新型RiPP。


图片来源:Chem. Sci.


综上,这个新的生物合成基因簇家族突出了未开发的天然产物的广度,这些天然产物具有结构上罕见的特征。

 

参考文献:Discovery and characterisation of an amidinecontaining ribosomally-synthesised peptide that is widely distributed in nature

Chem. Sci.

DOI: 10.1039/d1sc01456k

原文作者:Alicia H. Russell, Natalia M. Vior, Edward S. Hems, Rodney Lacret and Andrew W. Truman*


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