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亲电子天然产物的固相富集和分析

为了寻找新的天然产物,这可能导致开发用于各种应用的新药,需要新的方法。在这里,我们描述了粗提物中的亲电子天然产物的鉴定,它们通过它们作为亲核试剂的叠氮化物的反应性,然后使用可裂解的叠氮化物反应性树脂(CARR)随后进行富集。使用这种方法,在来自昆虫病原体Photorhabdus细菌的粗提取物中鉴定了携带环氧化物和α,β-不饱和烯酮以及几种未知化合物的天然产物

关键词: 叠氮化物; 点击化学丰富; 亲电子天然产物; 环氧化物; glidobactin; Photorhabdus ; 芪类


微生物是新型天然产物的主要来源,并随后开发用于各种应用的新药[1,2]例如,真菌天然产物环孢菌素作为免疫抑制药物的发现促进了现代器官移植[3,4]

分析方法的灵敏度越来越高,特别是在质谱分析中,可以对各种产生天然产物的微生物进行详细分析。已经鉴定出比原先想象的更多化合物,但通常这些化合物仅在非常低的水平产生。这也反映在细菌和真菌的基因组序列中,这些基因组序列经常编码许多生物合成基因簇(BGC),大多数相应的天然产物由于以下几个原因而未知:这些BGC在标准实验室条件下是沉默的[5],化合物也是如此不稳定的分离或它们的产量仍低于现代质谱仪的检测限。

因此,希望有多种可用的补充方法可以检测几种不同的天然产物类别。除了传统的化学筛选和生物活性引导分离外,天然产物固有特性的开发也是可行的。因此,天然产物的简单官能团如去氢丙氨酸[6,7],酮,醛[8,9],羧酸[8,9],胺[8-10],硫醇[8,9],醇[11 ],环氧化物[12],末端炔烃[13,14]和叠氮化物[15]可以针对性地引入标签。这样的标记可以增加与UV或质谱联用的液相色谱中的UV或MS检测的可见性。或者,天然产物可以通过利用它们的化学官能团固定在反应性树脂上,并且可以在洗掉所有非所需物质后洗脱[8,9,11,13,15]

最近引入的可裂解的叠氮化物反应性树脂(CARR(2),方案1)是能够与宽范围的叠氮化物反应的树脂[15]因此,可以研究含叠氮基的生物合成中间体或结构单元的代谢命运,并且可以鉴定含有这些叠氮化物的天然产物。

[1860-5397-13-43-I1]

方案1: 来自发光的 TT01 的XAD提取物的叠氮化原理,其含有1并随后用CARR(2进行叠氮化物富集在邻位叠氮基醇通过叠氮化物 - 炔烃环加成与树脂共价结合后,化合物3从树脂上裂解并通过HPLC-MS分析。反应条件:i)NaN 3,NH 4 Cl,80%MeOH的H 2 O 溶液,回流过夜; ii)CARR(2),ACN,55℃,1小时,然后是rt,过夜; iii)在PBS / CHCl 3 / MeOH 1:5:10(v / v / v)中的5mM TCEP ,1小时。

我们描述了使用叠氮化物作为亲核试剂来检测亲电子天然产物的CARR富集的应用。事实上,我们可以检测epoxystilbene 1来自不同的和三个glidobactins 光杆状菌和一些化合物以这样低的量使得它们不能在标准的粗提取物可检测的产生。

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