有机合成必掌握的三大检索方法

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    做合成的平时免不了会检索一些文献,如何高效检索对自己的有用信息就显得尤为重要,如果进实验室的话,往往是两眼黑,不知道如何下手,要下手往往是漫天刷浆,抓不住重点!那么如何能抓住重点,进行有目的的去读一些论文呢?今天为大家带来检索三大工具,希望对大家的工作有所帮助。

SciFinder Scholar

SciFinder Scholar是美国化学学会(ACS)旗下的化学文摘服务社CAS(Chemical Abstract Service)所出版的化学资料电子数据库学术版。

应用技巧:
1.SciFinder的一个小技巧,可能一开始我们使用SciFinder自带的结构式绘制工具,并不习惯。如果本来已经有用Chemdraw画好的结构式,把它另存为mol格式,然后在SciFinder的检索界面,点击File-Open,打开它,即可把它调入SciFinder进行检索。
2.在SCIFINDER上,很多反应直接检索反应式可能查不到,可以考虑将产品输入后,挑选匹配度较大的化合物,进行结构检索,会有意想不到的结果哦。另外,用PDF打印机将文章打印下来,再慢慢学习。里面的登陆号检索也是很有用的。可以查一般中间体的性质。
3.一般来说sicfinder我们常用的是structure search,可以进行单个化合物的search,也可以进行化学方程式search,可以进行分子式的search,还有CAS number的search,和关键词search。
4.structure search,主要问题是很多朋友把自己的最终想合成的结构画出来了,不管它有多么复杂。其实这个是错误的,你想你合成的东西几乎都是新的物质,scifinder那里能收录啊,只要没有人发表就没有收录。所以为了更准确的找到你想要的相关的合成文献,建议你自己先减肥,把不必要的一些结构给去掉,简化。

Beilstein

      CrossFire Beilstein是世界上最大的关于有机化学事实的数据库,数据来源于175种期刊,已收录9百多万个化合物和9百多万个反应。作为最基本的化学文献数据库,CrossFire Beilstein能帮助有机化学研究人员形成新思路、设计合成路径(包括起始原料和中间体)、确定生物活性和物理性质、了解外界环境对化合物的影响,等等。主要数据的索引分为3部分:化学物质部分收集了结构信息及相关的事实和参考文献,包括化学、物理和生物活性数据;反应部分提供化学物质制备的详细资料,帮助研究人员用反应式检索特定的反应路径;文献部分包括引用、文献标题和文摘,化学物质部分和反应部分的条目与文献部分有超链接。

      CrossFire Beilstein数据库是世界上最大的有机化学门户还可以在桌面上直接访问期刊上的文献原文。数据来源为1779~1959年《BeilsteinHandbook》、《Beilstein有机化学大全》从正编到第2检索方法四补编的全部内容和1960年以来的原始文献(各种国CrossFireGmelin/Beilstein数据库)。

      有3种基本检索方式:关键词检索(TextSearch)、数据检索(FactSearch)和结构检索(StructureSearch)。关键词检索方法相对简单。数据检索也称为快速检索(EasyDataSearch),对于没有结构的物质的查找十分有效。结构检索对化学工作者来说更加方便,也更直观,只须通过一个画图软件画出化合物(或反应)的部分或精确结构(可以添加各种结构限制),就可以开始检索了。在此基础上,系统还提供了组合检索和二次检索两种高级检索方式。

Web of Science

个人觉得Web of science使用比较方便,不像beilstein有那么多的检索方式,相对比较简单。我最常用的就是General Search,我觉得已经足够了。

检索的一些技巧:
1)、物质结构、反应方程式的检索
① Beilstein的CrossFire完全匹配检索较类似检索的优先等级高,按照优先等级依次进行检索,ISI的Web of Science可以自己选择采用完全匹配检索还是基础结构检索;
② 自己分析哪些部分是结构中次要的基团,自己进行替换。例如五元环用六元环代替,甲基用乙基代替等等;
③ 使用原子或者基团的模糊表示方法:X表示卤素原子,A表示非氢的原子,Q表示非碳且非氢的原子,M表示金属原子,基团的模糊化实例讲解时再讲。
2)、化合物名称检索:合成检索中最广泛使用的检索方式,可以使用检索语法。是提高检索水平的重要入手点。所有检索工具和数据库都能使用。
① 化合物名称不止一个,可以按照出现频率依次进行尝试;
例子:3-噻吩丙二酸就至少有一下两个名称:3-thiophenemalonic acid和3-thienylmalonic acid
② 要重视把化合物当成其母体的衍生物,查找其母体的化合物名称;
③ 要重视使用类型命名来进行检索;
例子:2-丁炔二酸的英文名为But-2-ynedioic acid,而所在类型名为alkyne carboxylic acid
3)、分子式检索:最常用于CA on CD,需要配合化合物名称共同使用。
4)、CAS号检索:最常用于CA on CD,精确无比。可以先使用Beilstein的CrossFire查找到CAS号再进行。

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