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2026 年,PROTAC 迎来了商业化元年的同时,Linker 化学也在加速分化。短刚性二炔、自组装六聚体纳米 PROTAC、无接头设计、大环化、三价 PROTAC——五条新路线同时被点亮。本文系统梳理 2026 年 PROTAC Linker 化学的五大新范式,并讨论它们对上游定制合成的需求变化。

一、为什么 Linker 突然成了焦点?
PROTAC(Proteolysis Targeting Chimera)由三个模块组成:
靶蛋白配体(warhead):识别目标蛋白;
E3 连接酶配体:招募 CRBN / VHL 等泛素连接酶;
Linker:连接两个配体,决定三元复合物的几何与稳定性。
传统观点认为 Linker 越"宽容"越好——长 PEG 链、烷基链都可以,因此 ARV-110、ARV-471 等早期临床分子都是柔性长链。但近两年学界意识到:
长链 Linker 让三元复合物出现太多可能构象,有效浓度被分散;
柔性链增加分子量,口服生物利用度下降;
不同靶蛋白 / 不同 E3 配体对 Linker 长度、刚性、亲脂性的需求差异极大,靠经验筛选代价昂贵。
于是 Linker 的"理性设计"成为 2026 年 PROTAC 化学最活跃的方向。
二、范式 1:短刚性二炔 Linker(4 原子跨度)
2026 年 4 月,爱丁堡大学 Hulme 课题组在 RSC Chemical Biology 报道了一种仅 4 原子的二炔(diyne)Linker,用于 BRD4 降解剂开发。
构象自由度被压到最低,三元复合物被锁在接近生物活性的构象;
生成的降解剂达到低纳摩尔活性;
二炔基团具有拉曼活性,可通过受激拉曼散射(SRS)显微镜实现 PROTAC 胞内摄取的无标记可视化——长期困扰 PROTAC 研究的"细胞内到底进了多少药"问题被巧妙化解。
三、范式 2:自组装六聚体纳米 PROTAC
国家纳米科学中心王浩团队 2025 年 11 月在 Angewandte Chemie 提出的桶状六聚体自组装 Linker:
空间自适应:Linker 不再是固定长度的"绳子",而是可以根据 POI 与 E3 的距离自主调节的智能结构;
广谱降解能力:可降解 22、55、68 kDa 等不同分子量的蛋白;
降解效率高达 99%;
血浆稳定性较线性 Linker 提升 48 倍。
这一设计把 Linker 从"被动的连接器"变成了"主动的构象调节器",是 2026 年 PROTAC 化学最具想象力的进展之一。
四、范式 3:无接头 AATac 系列
南方科技大学饶海团队 2025 年 5 月在 Nature Communications 的工作更进一步——直接证明 Linker 并非 PROTAC 的必需特征。
基于单氨基酸降解信号的 AATac(Pro-BA) 系列;
在降解 EML4-ALK、抑制肺癌细胞方面优于带 Linker 的版本;
具备口服可行性。
无接头设计挑战了"Linker 必不可少"的教条,为更小、更高效的降解剂开辟了新路径。
五、范式 4:大环化与三价 PROTAC
2026 年 Nature Protocols 报道了 Ciulli 课题组的 macroPROTAC-1 与 SIM1 合成方案:
macroPROTAC-1:通过大环约束把 PROTAC 锁在生物活性构象,减少非活性构象的熵损耗;
SIM1:在双功能 PROTAC 基础上增加第三个结合模块,提升靶蛋白亲和力与协同性;
两者相较经典双功能 MZ1,均展现增强的泛素化、更快的降解动力学和更高的亚型选择性。
六、范式 5:双靶 / 多靶 PROTAC
2026 年 7 月 Journal of Medicinal Chemistry 报道了 V-12c——同时降解 ERα 和 HDAC6 的双靶 PROTAC:
一石二鸟:单一分子同时降解两个靶蛋白;
ERα 降解:克服内分泌耐药;
HDAC6 降解:调控肿瘤表观遗传与蛋白稳态;
在他莫昔芬耐药乳腺癌模型中展现显著抗肿瘤活性。
双靶 PROTAC 对 Linker 提出了更高要求——必须同时适配两个靶蛋白结合口袋与 E3 之间的几何关系。
七、五大范式对定制合成的需求矩阵
八、纳孚生物在 PROTAC 定制合成上的能力
纳孚生物在 PROTAC 相关配体和连接子定制合成方面积累了丰富项目经验:
E3 配体:CRBN(来那度胺 / 泊马度胺衍生物)、VHL 配体、IAP 配体;
靶蛋白配体:按客户需求定制合成各类激酶抑制剂、溴域配体等;
Linker 库:PEGₙ(n=1–12)、烷基链、刚性 Linker(炔基、芳环)、功能性 Linker(DBCO、TCO、生物素、荧光);
完整 PROTAC 分子:从 mg 到 g 级全流程合成;
质控标准:HPLC ≥95%,¹H NMR + HRMS 全覆盖。
九、写在最后
Linker 化学的"范式分化",意味着 PROTAC 的合成不再是"接一段 PEG"那么简单。每一个新范式背后,都是一整套新中间体、新反应、新质控。对高校和 Biotech 课题组来说,找到一个能在小批量、多品类上稳定交付的化学合作方,比找到一个"什么都能做"的供应商更现实。
如果你正在做 PROTAC 相关研究,需要 CRBN / VHL 配体、定制 Linker、或者完整 PROTAC 分子的合成服务,欢迎联系纳孚生物。
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